Набор реагентов для генотипирования ДНК с последующей детекцией на биологических микрочипах панель SP-50 (проект «Спорт»)
Набор реагентов «SP50» предназначен для генотипирования полиморфизмов человека, для которых установлена ассоциация со спортивными качествами индивида.
Область применения набора: научно-исследовательские и спортивные лаборатории.
Набор позволяет генотипировать следующие генетические маркеры: rs4341, rs1815739, rs1042713, rs699, rs11091046, rs4917, rs17602729, rs1049305, rs17664695, rs17734766, rs8111989, rs12722, rs4680, rs6878578, rs939787, rs560887, rs10196189, rs2273555, rs852918, rs1799945, rs11549465, rs35767, rs1800795, rs5219, rs17070145, rs2361797, rs7582693, rs1049434, rs6502557, rs1801131, rs2050019, rs4409473, rs3857490, rs17685537, rs1572312, rs2070744, rs4253778, rs1801282, rs8192678, rs2457571, rs4880, rs10397, rs7832552, rs660339, rs1800849, rs17671289, rs2010963, rs1870377, rs2081174, rs4626333.
Состав набора
Набор «SP50» рассчитан на проведение 50 исследований образцов, включая положительные и отрицательные контрольные образцы.
В состав набора реагентов входят следующие компоненты:
Компоненты для амплификации:
- ПЦР-буфер (буфер с MgCl2 для ПЦР) – 1 пробирка (330 мкл)
- Праймеры – 1 пробирка (165 мкл)
- Полимераза – 1 пробирка (50 мкл)
- Вода (деионизованная вода для проведения ПЦР) – 1 пробирка (800 мкл)
Компоненты для гибридизации:
- ГПБ (гибридизационно-промывочный буфер) – 1 флакон (20 мл)
- Формамид – 1 пробирка (400 мкл)
- Биочипы – 50 шт.
Дополнительные материалы:
- Паспорт набора (1 экз. на поставку)
- Инструкция по применению (1 экз. на поставку)
Состав панели SNP
№ п/п | ген | снип | № п/п | ген | снип |
1 | ACE | rs4341 | 26 | AGTR2 | rs11091046 |
2 | ADRB2 | rs1042713 | 27 | AQP1 | rs1049305 |
3 | AGT | rs699 | 28 | COL5A1 | rs12722 |
4 | AHSG | rs4917 | 29 | MCT1 | rs1049434 |
5 | GALNT13 | rs10196189 | 30 | HFE | rs1799945 |
6 | IGF1 | rs35767 | 31 | KCNJ11 | rs5219 |
7 | LILRB2 | rs2361797 | 32 | MYB | rs2050019 |
8 | SOD2 | rs4880 | 33 | NFIA-AS2 | rs1572312 |
9 | TRHR | rs7832552 | 34 | NOS3 | rs2070744 |
10 | ACTN3 | rs1815739 | 35 | SLC22A3 | rs2457571 |
11 | AMPD1 | rs17602729 | 36 | UCP2 | rs660339 |
12 | ARHGEF28 | rs17664695 | 37 | UCP3 | rs1800849 |
13 | CALCR | rs17734766 | 38 | VEGFA | rs2010963 |
14 | CKM | rs8111989 | 39 | VEGFR2 | rs1870377 |
15 | MTHFR | rs1801131 | 40 | NACC2 | rs4409473 |
16 | PPARA | rs4253778 | 41 | near SMIM20 | rs17685537 |
17 | PPARG | rs1801282 | 42 | CTC-229L21.1 | rs6878578 |
18 | SUCLA2 | rs10397 | 43 | Near CNR1 | rs3857490 |
19 | DMD | rs939787 | 44 | WWOX | rs2081174 |
20 | G6PC2 | rs560887 | 45 | KIBRA | rs17070145 |
21 | GBF1 | rs2273555 | 46 | COMT | rs4680 |
22 | GPC5 | rs852918 | 47 | MPRIP | rs6502557 |
23 | HIF1A | rs11549465 | 48 | PPARGC1A | rs8192678 |
24 | IL6 | rs1800795 | 49 | UGT2B4 | rs17671289 |
25 | LRPPRC | rs7582693 | 50 | ZNF608 | rs4626333 |
Набор «SP50» предназначен для анализа любых биологических следов, содержащих геномную ДНК человека. Для анализа ДНК должна быть выделена методом, наиболее подходящим для исследуемого объекта. Реагенты для выделения ДНК не входят в состав набора.
Набор реагентов предназначен для качественного анализа.
Только для профессионального применения в научных целях.
Аналитические характеристики набора
Набор «SP50» обеспечивает:
- мультиплексную ПЦР, в ходе которой происходит амплификация и флуоресцентное маркирование 50 целевых фрагментов генома человека;
- проведение гибридизационного анализа с использованием 100 дифференцирующих олигонуклеотидных зондов, иммобилизованных на биологическом микрочипе.
Видовая специфичность. Набор абсолютно специфичен для ДНК человека; примеси геномов других биологических видов не искажают результат. Специфичность генотипирования обеспечивается на двух уровнях:
- на стадии ПЦР — специфичностью праймеров, которые выбраны таким образом, чтобы не иметь никаких локусов отжига, кроме целевых, расположенных в геноме человека;
- на стадии гибридизации — специфичностью олигонуклеотидных зондов, комплементарных только аллельным последовательностям внутри амплифицированного локуса.
Чувствительность. Рекомендуемое количество анализируемой ДНК составляет >1 нг. При концентрации менее 1 нг/мкл следует, по возможности, увеличить объем образца, вносимого в ПЦР. Верхний предел концентрации ДНК не лимитирован; нормирование концентрации не требуется.
