Набор реагентов «ChipInDel» — Центр исследования ДНК

Набор реагентов «ChipInDel» для генетической идентификации личности и установления биологического родства

Набор реагентов «ChipInDel» предназначен для проведения экспертиз по генетической идентификации личности и установления биологического родства по образцам геномной ДНК человека.

Область применения набора: лаборатории экспертно-криминалистических и судебно-медицинских учреждений, а также научно-исследовательские лаборатории.

Набор позволяет генотипировать 101 короткий генетический маркер (инсерции и делеции) и фрагмент гена AMEL, ассоциированного с половой принадлежностью.

Набор «ChipInDel» предназначен для анализа любых биологических следов, содержащих геномную ДНК человека: кровь, сперма, слюна, луковицы волос, потожировые следы, фрагменты одежды и так далее. Для анализа ДНК должна быть выделена наиболее подходящим для исследуемого объекта методом. Реагенты для выделения ДНК не входят в состав набора.

Тест-система «ChipInDel» защищена российским патентом № 2738752 от 06.02.2020.

Состав набора

Набор реагентов «ChipInDel» рассчитан на проведение 50 исследований образцов, включая положительные и отрицательные контрольные образцы.

В состав набора реагентов входят следующие компоненты:

Реагенты для амплификации:

ПЦР-буфер (буфер с MgCl2 для ПЦР) – 1 пробирка (330 мкл)
Праймеры – 1 пробирка (165 мкл)
Полимераза – 1 пробирка (50 мкл)
Вода (деионизованная вода для ПЦР) – 1 пробирка (800 мкл)

Реагенты для гибридизации:

ГПБ (гибридизационно-промывочный буфер) – 1 флакон (20 мл)
Формамид – 1 пробирка (400 мкл)
Биочипы – 50 шт.

Дополнительные материалы:

Паспорт набора (1 экз. на поставку) Инструкция по применению (1 экз. на поставку)
Шаблон «CID***.tpl» для анализа биочипов программой ImaGel Studio поставляется вместе с автоматическим генетическим анализатором молекул ДНК «Пикодетект». При обновлении версии ПО возможно доукомплектование поставки электронным носителем с программами.

Аналитические характеристики набора

Набор «ChipInDel» обеспечивает:

мультиплексную ПЦР, в ходе которой происходит амплификация и флуоресцентное маркирование 102 целевых фрагментов генома человека;
проведение гибридизационного анализа с использованием 204 дифференцирующих олигонуклеотидных зондов, иммобилизованных на биологическом микрочипе.

Видовая специфичность: Набор абсолютно специфичен для ДНК человека; примеси геномов других биологических видов не искажают результат. Специфичность генотипирования обеспечивается на двух уровнях:

на стадии ПЦР — специфичностью праймеров, которые выбраны таким образом, чтобы не иметь никаких локусов отжига, кроме целевых, расположенных в геноме человека;
на стадии гибридизации — специфичностью олигонуклеотидных зондов, комплементарных только аллельным последовательностям внутри амплифицированного локуса.

Чувствительность. Рекомендуемое количество анализируемой ДНК составляет >0,1 нг. При концентрации менее 0,1 нг/мкл следует, по возможности, увеличить объем образца, вносимого в ПЦР. Верхний предел концентрации ДНК не лимитирован, нормирование концентрации не требуется. Аналитическая чувствительность набора в отсутствие ингибиторов ПЦР приведена в таблице.

Генотипирование деградированных образцов. При создании набора были минимизированы расстояния между праймерными парами. Благодаря этому средняя длина ампликонов составляет 78 п.н., что повышает вероятность успешного генотипирования образцов ДНК, подвергшихся деградации (фрагментации). Распределение длин локусов приведено на диаграмме.

Генотипирование смешанных образцов. Генотипирование смешанных образцов не позволяет получить надежную идентифицирующую информацию. Для получения достоверных данных необходимо выделить индивидуальный генетический материал. В отдельных случаях набор позволяет обнаружить примесь анализируемой ДНК в смеси. Также при анализе смеси двух компонентов можно выделить ту часть профиля, которая будет полностью совпадать у образцов, входящих в анализируемую смесь.

Анализируемая панель генов

Генетические маркеры, входящие в набор «ChipInDel»

№	ID полиморфизма	Наименование	Частоты генотипов и аллелей в исследованной российской популяции					Вероятность случайного совпадения
№	ID полиморфизма	Наименование	In/In	In/Del	Del/Del	In	Del	Matching Probability
1	rs10617833	CID.01-041	0,3858	0,4569	0,1573	0,6142	0,3858	0,38235
2	rs72082809	CID.01-155	0,2247	0,5187	0,2566	0,4841	0,5159	0,38540
3	rs35379245	CID.01-171	0,1477	0,4561	0,3963	0,3757	0,6243	0,38683
4	rs71107464	CID.01-192	0,3383	0,4804	0,1813	0,5785	0,4215	0,37809
5	rs10693974	CID.02-012	0,1308	0,4206	0,4486	0,3411	0,6589	0,39523
6	rs66610049	CID.02-036	0,3103	0,5178	0,1720	0,5692	0,4308	0,39392
7	rs57616890	CID.02-042	0,4654	0,4093	0,1252	0,6701	0,3299	0,39986
8	rs72339906	CID.02-080	0,3850	0,4598	0,1551	0,6150	0,3850	0,38376
9	rs111665673	CID.02-215	0,1873	0,4644	0,3483	0,4195	0,5805	0,37208
10	rs57993635	CID.02-231	0,1554	0,4494	0,3951	0,3801	0,6199	0,38228
11	rs35926392	CID.03-016	0,3346	0,4860	0,1794	0,5776	0,4224	0,38032
12	rs66976303	CID.03-063	0,1776	0,4972	0,3252	0,4262	0,5738	0,38451
13	rs35291341	CID.03-100	0,1364	0,4505	0,4131	0,3617	0,6383	0,39218
14	rs35464243	CID.03-107	0,1065	0,4075	0,4860	0,3103	0,6897	0,41357
15	rs10540628	CID.03-124	0,3146	0,5056	0,1798	0,5674	0,4326	0,38695
16	rs59170274	CID.04-027	0,3234	0,4972	0,1794	0,5720	0,4280	0,38397
17	rs56281469	CID.04-056	0,0681	0,3592	0,5728	0,2476	0,7524	0,46171
18	rs35932180	CID.04-085	0,1182	0,3959	0,4859	0,3161	0,6839	0,40681
19	rs72273695	CID.04-112	0,5196	0,3869	0,0935	0,7131	0,2869	0,42845
20	rs3067059	CID.04-177	0,1200	0,4533	0,4267	0,3467	0,6533	0,40196
21	rs34159280	CID.05-014	0,4112	0,4841	0,1047	0,6533	0,3467	0,41442
22	rs142490175	CID.05-065	0,4150	0,4561	0,1290	0,6430	0,3570	0,39682
23	rs34990478	CID.05-096	0,3533	0,4748	0,1720	0,5907	0,4093	0,37977
24	rs6149192	CID.05-116	0,2344	0,4934	0,2722	0,4811	0,5189	0,37247
25	rs71621395	CID.05-120	0,3215	0,4935	0,1850	0,5682	0,4318	0,38110
26	rs66881681	CID.05-132	0,4729	0,4374	0,0897	0,6916	0,3084	0,42299
27	rs10701589	CID.05.141	0,2116	0,5225	0,2659	0,4728	0,5272	0,38847
28	rs3832355	CID.05-151	0,3813	0,4654	0,1533	0,6140	0,3860	0,38550
29	rs10560231	CID.05-180	0,3240	0,4569	0,2191	0,5524	0,4476	0,36175
30	rs35948562	CID.06-007	0,0974	0,4513	0,4513	0,3230	0,6770	0,41685
31	rs56071028	CID.06-016	0,1589	0,4486	0,3925	0,3832	0,6168	0,38056
32	rs10529292	CID.06-031	0,1327	0,4486	0,4187	0,3570	0,6430	0,39415
33	rs68133212	CID.06-071	0,4318	0,4336	0,1346	0,6486	0,3514	0,39259
34	rs11267328	CID.06-077	0,3427	0,4850	0,1723	0,5852	0,4148	0,38237
35	rs3831872	CID.06-087	0,1311	0,4401	0,4288	0,3511	0,6489	0,39475
36	rs56343259	CID.06-096	0,1477	0,4822	0,3701	0,3888	0,6112	0,39133
37	rs141141409	CID.06-125	0,1290	0,4822	0,3888	0,3701	0,6299	0,40035
38	rs57057239	CID.06-135	0,3621	0,5122	0,1257	0,6182	0,3818	0,40926
39	rs6149835	CID.06-143	0,4692	0,4168	0,1140	0,6776	0,3224	0,40685
40	rs11278298	CID.06-159	0,4262	0,4579	0,1159	0,6551	0,3449	0,40476
41	rs68111476	CID.07-023	0,4457	0,4307	0,1236	0,6610	0,3390	0,39943
42	rs1610906	CID.07-082	0,2093	0,4860	0,3047	0,4523	0,5477	0,37283
43	rs57943214	CID.07-097	0,1047	0,4262	0,4692	0,3178	0,6822	0,41269
44	rs3216282	CID.07-126	0,4206	0,4523	0,1271	0,6467	0,3533	0,39763
45	rs35604660	CID.08-058	0,2037	0,4766	0,3196	0,4421	0,5579	0,37085
46	rs34067160	CID.08-064	0,1756	0,4671	0,3573	0,4092	0,5908	0,37666
47	rs35679778	CID.08-103	0,1629	0,4438	0,3933	0,3848	0,6152	0,37817
48	rs6150855	CID.08-140	0,4019	0,4486	0,1495	0,6262	0,3738	0,38510
49	rs34499887	CID.09-084	0,2500	0,5240	0,2260	0,5120	0,4880	0,38817
50	rs71953876	CID.09-133	0,4262	0,4505	0,1234	0,6514	0,3486	0,39976
51	rs10552811	CID.10-071	0,3464	0,4944	0,1592	0,5936	0,4064	0,38977
52	rs5786663	CID.10-085	0,3577	0,4682	0,1742	0,5918	0,4082	0,37744
53	rs140576359	CID.10-118	0,3458	0,5103	0,1439	0,6009	0,3991	0,40067
54	rs10544160	CID.10-128	0,3107	0,4971	0,1922	0,5592	0,4408	0,38057
55	rs113764748	CID.11-020	0,3173	0,4865	0,1962	0,5606	0,4394	0,37588
56	rs74933486	CID.11-084	0,3589	0,5121	0,1290	0,6150	0,3850	0,40772
57	rs35847449	CID.11-094	0,1201	0,4878	0,3921	0,3640	0,6360	0,40613
58	rs56221618	CID.11-111	0,4216	0,4496	0,1287	0,6465	0,3535	0,39652
59	rs11394480	CID.11-135	0,1383	0,4374	0,4243	0,3570	0,6430	0,39047
60	rs10689649	CID.12-090	0,1386	0,4663	0,3951	0,3717	0,6283	0,39276
61	rs56392226	CID.13-039	0,3689	0,4906	0,1404	0,6142	0,3858	0,39655
62	rs59502417	CID.13-087	0,3813	0,4561	0,1626	0,6093	0,3907	0,37984
63	rs67320356	CID.15-067	0,2566	0,6094	0,1340	0,5613	0,4387	0,45520
64	rs3995812	CID.15-097	0,1140	0,4748	0,4112	0,3514	0,6486	0,40750
65	rs3841767	CID.16-024	0,3439	0,5028	0,1533	0,5953	0,4047	0,39459
66	rs5821134	CID.17-057	0,2467	0,4729	0,2804	0,4832	0,5168	0,36312
67	rs141730340	CID.17-083	0,4505	0,4430	0,1065	0,6720	0,3280	0,41051
68	rs35452393	CID.18-030	0,3058	0,4897	0,2045	0,5507	0,4493	0,37513
69	rs33990768	CID.18-051	0,2734	0,4925	0,2341	0,5197	0,4803	0,37211
70	rs112877961	CID.19-029	0,4202	0,4734	0,1065	0,6568	0,3432	0,41195
71	rs35894782	CID.20-020	0,4224	0,4336	0,1439	0,6393	0,3607	0,38721
72	rs34198404	CID.20-058	0,3458	0,4935	0,1607	0,5925	0,4075	0,38891
73	rs10583984	CID.21-038	0,3858	0,4869	0,1273	0,6292	0,3708	0,40210
74	rs35282131	CID.21-042	0,3645	0,4673	0,1682	0,5981	0,4019	0,37951
75	rs60228580	CID.22-033	0,1776	0,4879	0,3346	0,4215	0,5785	0,38147
76	rs76841692	CID.01-059	0,1505	0,4495	0,4000	0,3752	0,6248	0,38471
77	rs56992628	CID.04-157	0,4710	0,4374	0,0916	0,6897	0,3103	0,42156
78	rs10605092	CID.05-171	0,2991	0,5140	0,1869	0,5561	0,4439	0,38859
79	rs10654334	CID.07-107	0,1818	0,4636	0,3545	0,4136	0,5864	0,37372
80	rs3840626	CID.07.122	0,2326	0,5103	0,2570	0,4878	0,5122	0,38062
81	rs57643911	CID.08-086	0,1832	0,5421	0,2748	0,4542	0,5458	0,40288
82	rs74835353	CID.09-088	0,4692	0,4280	0,1028	0,6832	0,3168	0,41389
83	rs10624287	CID.10-035	0,1367	0,4157	0,4476	0,3446	0,6554	0,39183
84	rs67091351	CID.10-079	0,3028	0,4991	0,1981	0,5523	0,4477	0,38001
85	rs72294111	CID.10-091	0,3539	0,4438	0,2022	0,5758	0,4242	0,36315
86	rs71019801	CID.10-121	0,0935	0,4879	0,4187	0,3374	0,6626	0,42204
87	rs36030410	CID.11-027	0,3199	0,4431	0,2370	0,5415	0,4585	0,35486
88	rs57958958	CID.11-034	0,4318	0,4187	0,1495	0,6411	0,3589	0,38409
89	rs112814977	CID.11-061	0,3764	0,4551	0,1685	0,6039	0,3961	0,37716
90	rs3841764	CID.12-002	0,3346	0,5047	0,1607	0,5869	0,4131	0,39248
91	rs113510588	CID.12-062	0,4841	0,4262	0,0897	0,6972	0,3028	0,42403
92	rs10571534	CID.12-075	0,3720	0,4897	0,1383	0,6168	0,3832	0,39731
93	rs10643722	CID.12-096	0,1030	0,4588	0,4382	0,3324	0,6676	0,41313
94	rs76684969	CID.12-100	0,3159	0,4991	0,1850	0,5654	0,4346	0,38309
95	rs71099963	CID.13-031	0,3402	0,5121	0,1477	0,5963	0,4037	0,39983
96	rs61306979	CID.13-070	0,1402	0,4692	0,3907	0,3748	0,6252	0,39237
97	rs3048498	CID.15-046	0,3813	0,4841	0,1346	0,6234	0,3766	0,39787
98	rs35023498	CID.18-001	0,0860	0,3907	0,5234	0,2813	0,7187	0,43391
99	rs113931262	CID.19-036	0,3895	0,4607	0,1498	0,6199	0,3801	0,38638
100	rs11283124	CID.20-035	0,2224	0,4991	0,2785	0,4720	0,5280	0,37611
101	rs10535329	CID.20-046	0,4860	0,4093	0,1047	0,6907	0,3093	0,41470
102	—	AMEL
								1,08E-41

Эксплуатационные характеристики

Универсальность

При создании тест-системы ChipInDel был проанализирован весь геном и сформирована универсальная межпопуляционная панель, состоящая из маркеров, обладающих близким по значению дискриминирующим потенциалом в каждой из пяти основных мировых популяций (европейской, африканской, южноазиатской, восточноазиатской и американской).

Панель InDel-маркеров, используемая в тест-системе ChipInDel, является универсальной вне зависимости от популяции. Средние значения частоты минорной аллели (которые в конечном итоге определяют ключевую величину – MP), рассчитанные исходя из данных исследования «1000 Genomes Project», практически не отличаются и составляют для европейской популяции 39,8%, африканской – 39,4%, южноазиатской – 39,9%, восточноазиатской – 39,8% и американской – 39,6%.

Это свидетельствует об универсальности выбранной панели маркеров, учитывая крайнюю полярность африканского, азиатского и европейского генофондов.

Универсальность подтверждена исследованием популяции Эквадора. По итогам опубликована статья в высокорейтинговом международном журнале Biology.

Практическая ценность

Высокая практическая ценность тест-системы ChipInDel достигнута за счет следующих решений:

Использование большого числа генетических маркеров, что повышает идентифицирующий потенциал и снижает показатель MP (вероятность случайного совпадения) до 1,08·10^-41. Это позволяет с большей вероятностью (в сравнении с STR) идентифицировать личность и устанавливать кровное родство при частичном совпадении генотипа с имеющимся в национальной базе.
Сокращение средней длины амплифицируемых локусов до 72,8 п.н. и максимальной до 97 нуклеотидов, что позволяет успешно генотипировать образцы ДНК, деградированные вследствие воздействия внешних факторов.
Использование InDel-маркеров, имеющих низкую частоту мутаций (10^-8), что в 100 000 – 1 000 000 раз ниже, чем у STR-маркеров (10^-2 — 10^-3).
За счет большого числа маркеров можно идентифицировать образцы с предельно низкими концентрациями ДНК. Даже если будет получен генотип только по 30% точек, значение МР составит 1·10^-12.

ChipInDel может использоваться как универсальный инструмент для установления кровного родства, идентификации деградированных образцов и опознания.

Высокая производительность

Высокая производительность тест-системы ChipInDel достигнута за счет следующих решений:

простого и производительного протокола исследования с использованием мультиплексной ПЦР: «1 образец – 1 пробирка – 1 биочип»;
исключения из протокола трудоемких и затратных этапов, присущих другим методам, таких как измерение и нормализация концентрации ДНК;
автоматизации детектирования результатов за счет использования анализатора биочипов и специализированного программного обеспечения.

Пример анализа биологического микрочипа ChipInDel

Примеры отчетов по идентификации и установлению биологического родства

Наши публикации

Поддержка продукта

Инструкция

по применению набора реагентов «ChipInDel» для генетической идентификации личности и установления биологического родства

Читать

Сертификат соответствия

Набор реагентов «ChipInDel» для генетической идентификации личности и установления биологического родства по ТУ 20.59.52-002-15741966-2024

Скачать

Руководство

по работе с программой автоматизации генетической идентификации личности и установления биологического родства «Chip-ID»

Читать

Программное обеспечение

автоматизации генетической идентификации личности и установления биологического родства «Chip-ID»

Скачать

Шаблоны для программного обеспечения IMAGEWARE

Шаблон CID99v8 2025 родство

Шаблон анализа биологических микрочипов, поставляемых в наборе реагентов «ChipInDel» (версия чипа v8 выпускаемая с января 2025 года). Шаблон используется для анализа чистых образцов ДНК при установлении биологического родства.

Скачать

Шаблон CID99v8 20% coef7

Шаблон анализа биологических микрочипов, поставляемых в наборе реагентов «ChipInDel» (версия чипа v8 выпускаемая с января 2025 года). Шаблон используется для анализа криминалистических образцов ДНК.

Скачать

Набор реагентов «ChipInDel» для генетической идентификации личности и установления биологического родства

Состав набора

Аналитические характеристики набора

Анализируемая панель генов

Эксплуатационные характеристики

Пример анализа биологического микрочипа ChipInDel

Примеры отчетов по идентификации и установлению биологического родства

Наши публикации

Поддержка продукта

Инструкция

Сертификат соответствия

Руководство

Программное обеспечение

Шаблоны для программного обеспечения IMAGEWARE

Шаблон CID99v8 2025 родство

Шаблон CID99v8 20% coef7

Поделиться страницей

dnarescenter@gmail.com | тел. +7 964 719-50-00