Набор реагентов «FMF-14» для генотипирования ассоциированных c периодической болезнью человека мутаций в гене MEFV и полиморфизмов в гене SAA
Набор реагентов «FMF-14» предназначен для генотипирования 12 мутаций в гене MEFV, ассоциированных с возникновением периодической болезни (средиземноморской лихорадки) человека, а также двух полиморфизмов в гене SAA, связанных с течением заболевания.
Набор «FMF-14» предназначен для анализа любого биологического материала, содержащего геномную ДНК человека: кровь, слюна, и так далее. Для анализа ДНК должна быть выделена наиболее подходящим для исследуемого объекта методом. Реагенты для выделения ДНК в состав набора не входят.
Состав набора
Набор «FMF-14» рассчитан на проведение 50 исследований образцов, включая положительные и отрицательные контрольные образцы. В состав набора реагентов входят следующие компоненты:
Реагенты для амплификации:
- ПЦР-буфер (буфер с MgCl2 для ПЦР) – 1 пробирка (330 мкл)
- Праймеры – 1 пробирка (165 мкл)
- Полимераза – 1 пробирка (50 мкл)
- К+ (мужская ДНК без мутаций, 3 нг/мкл) – 1 пробирка (5 мкл)
- Вода (деионизованная вода для проведения ПЦР) – 1 пробирка (800 мкл)
Реагенты для гибридизации и биочипы:
- Формамид – 1 пробирка (550 мкл)
- ГПБ (гибридизационно-промывочный буфер) – 1 флакон (20 мл)
- Биочипы – 50 шт.
Дополнительные материалы (1 экз. на поставку):
- Инструкция по применению
- Номограмма (опционально)
Аналитические характеристики набора
Набор «FMF-14» обеспечивает:
- мультиплексную ПЦР, в ходе которой происходит амплификация и флуоресцентное мечение целевых фрагментов генома человека;
- проведение гибридизационного анализа с использованием дифференцирующих олигонуклеотидных зондов, иммобилизованных на биологическом микрочипе.
Видовая специфичность. Набор абсолютно специфичен для ДНК человека; примеси геномов других биологических видов не искажают результат. Специфичность генотипирования обеспечивается на двух уровнях:
- на стадии ПЦР — специфичностью праймеров, которые выбраны таким образом, чтобы не иметь никаких локусов отжига, кроме целевых, расположенных в геноме человека;
- на стадии гибридизации — специфичностью олигонуклеотидных зондов, комплементарных только аллельным последовательностям внутри амплифицированного локуса.
Чувствительность. Рекомендуемое количество анализируемой ДНК составляет 1 нг и более. При концентрации менее 1 нг/мкл следует, по возможности, увеличить объем образца, вносимого в ПЦР. Верхний предел концентрации ДНК не лимитирован. Присутствие ингибиторов ПЦР в образце ДНК может приводить к выпадению информации по отдельным локусам.
Генетические мутации в гене MEFV и полиморфизмы в гене SAA, генотипируемые набором “FMF-14”
№ | Наименование мутации | Номер полиморфизма rs# | Расположение в геноме |
1. | MEFV E148Q c.442G>C | rs3743930 | Chr. 16:3254626 |
2. | MEFV P369S c.1105C>T | rs11466023 | Chr. 16:3249586 |
3. | MEFV F479L c.1437C>G | rs104895083 | Chr. 16:3247166 |
4. | MEFV M680I (G/C) c.2040G>C | rs28940580 | Chr. 16:3243447 |
5. | MEFV M680I (G/A) c.2040G>A | rs28940580 | Chr. 16:3243447 |
6. | MEFV I692del c.2076_2078del | rs104895093 | Chr. 16:3243409-3243413 |
7. | MEFV M694V c.2080A>G | rs61752717 | Chr. 16:3243407 |
8. | MEFV M694I c.2082G>A | rs28940578 | Chr. 16:3243405 |
9. | MEFV K695R c.2084A>G | rs104895094 | Chr. 16:3243403 |
10. | MEFV V726A c.2177T>C | rs28940579 | Chr. 16:3243310 |
11. | MEFV A744S c.2230G>T | rs61732874 | Chr. 16:3243257 |
12. | MEFV R761H c.2282G>A | rs104895097 | Chr. 16:3243205 |
13. | SAA1 c.209C>T | rs1136743 | Chr. 11:18269312 |
14. | SAA1 c.224T>C | rs1136747 | Chr. 11:18269327 |