УНИВЕРСАЛЬНАЯ ПАНЕЛЬ ИНСЕРЦИОННО-ДЕЛЕЦИОННЫХ ПОЛИМОРФИЗМОВ ChipID106 ДЛЯ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ ИДЕНТИФИКАЦИИ ЛИЧНОСТИ И БИОЧИП НА ЕЕ ОСНОВЕ
Предложен новый подход к генетической идентификации личности, включающий панель из 106 инсерционно-делеционных (InDel) полиморфизмов и метод их генотипирования на биологических микрочипах. Такие фундаментальные свойства InDel-маркеров, как малая длина и низкая частота мутирования, обеспечивают им существенные преимущества в экспертной практике перед широко используемыми тандемными повторами (STR). В настоящей работе проанализировано распределение аллелей всех известных InDel-полиморфизмов в пяти крупнейших мировых популяциях (европейской, восточно-азиатской, южно-азиатской, африканской и американской), отобраны
маркеры, отвечающие следующим критериям: частота минорного аллеля более 0.30, физическое расстояние между маркерами более 3 млн.п.н., отсутствие во фланкирующих последовательностях полиморфизмов, тандемных повторов и палиндромов, соотношение AT/GC близкое к 1. Сформирована панель из 106 полиморфизмов со средней частотой минорного аллеля 0.396 во всех пяти популяциях. Разработан метод генотипирования панели, включающий одностадийную мультиплексную ПЦР с последующей гибридизацией на биологическом микрочипе. Средняя длина ампликона составила 72 п.н. На выборке из 201 жителя Москвы и Санкт-Петербурга определены основные характеристики сформированной панели: вероятность случайного совпадения, равная 1.89 × 10–43, потенциал исключения отцовства (CPE) 0.99999999063. Предлагаемый метод представляет собой альтернативу молекулярно-генетической идентификации личности, основанной на вариациях длин STR-локусов.
Ключевые слова: идентификация личности, биочип, криминалистика, InDel-полиморфизмы
DOI: 10.31857/S0026898423040067, EDN: QLARZQ
Полная версия статьи
УНИВЕРСАЛЬНАЯ ПАНЕЛЬ ИНСЕРЦИОННО-ДЕЛЕЦИОННЫХ ПОЛИМОРФИЗМОВ ChipID106 ДЛЯ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ ИДЕНТИФИКАЦИИ ЛИЧНОСТИ И БИОЧИП НА ЕЕ ОСНОВЕ
Набор реагентов «ChipInDel»
для генетической идентификации личности и установления биологического родства